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在污水處理的凈化過程中，微生物通常主要降解和轉化污水有害化合物中的有機物。以下小系列將介紹微生物在污水處理設備運行中如何凈化水質。
1.細菌的降解作用.真菌和藻類可以降解有機污染物。例如，好氧革蘭氏陰性桿菌和球菌可以降解石油烴.有機磷農藥.氯苯等。;霉菌可以降解石油烴.敵百蟲.撲草凈等;藻類可以降解多種酚類化合物。
2.共同代謝。共同代謝是指微生物可以分解有機基質，但不能將其用作能量和組成元素的現象。這種微生物有假單胞菌屬.不動桿菌屬.諾卡氏菌屬.芽孢桿菌屬等。
3.去毒作用。去毒作用是指微生物通過轉化程.降解.礦化.聚合等反應改變污染物的分子結構，從而降低或消除其毒性。例如，馬拉硫磷，一種有機磷農藥，有機磷農藥馬拉硫磷可以分解成含有一種酸或二酸的物質。
值得注意的是，微生物的作用是復雜的，一些微生物在凈化的同時也有毒性。從而產生新的污染。例如，三氯乙烯可以在微生物的作用下轉化為氯乙烯，這是一種強致癌物。因此，在使用微生物凈化的同時，有必要密切監測系統中有機物分解的中間產物、產物及其毒性。
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